Le Conseil de la Croix-Rouge assure la direction stratégique de la CRS. Il se compose de neuf membres. Le président de la CRS assume des fonctions de représentation de la Croix-Rouge suisse et du Conseil de la Croix-Rouge. Il a pour mission de préserver et de promouvoir l’unité de la CRS.
L’Assemblée de la Croix-Rouge est l’organe suprême de la Croix-Rouge suisse. Elle se compose de délégués des associations cantonales Croix-Rouge et des membres corporatifs.